早田进回到「科学特搜队」继续值勤,开始展开与超人力霸王共同守护地球的任务。
看似和平的宇宙,却突然出现了一艘搭载20亿3000万巴尔坦星人的巨大战舰,邪恶的巴尔坦星人由于巴尔坦星寿命将近,得知地球适合居住之后,便搭乘宇宙战舰前来,准备佔领地球。
巴尔坦星人派出最强的战士、宇宙忍者降临地球,宇宙忍者的身高伸缩自如,可以缩小到一公釐,再长高到50公尺,体重则从1公克变化到5000公吨,外形类似螃蟹,不但具有隐形术及分身术,两隻如同大剪刀的钳手更发发射冻结光线限制对手的行动,破坏力强大,人类惊慌逃逸。
「科学特搜队」急忙出动战斗机,以飞弹及雷射光对抗宇宙忍者,但是宇宙忍者行踪飘忽,战斗机纷纷被牠击落,「科学特搜队」节节败退,早田进见情形不对,便以变身器化身超人力霸王。
超人力霸王肌肉健壮,动作敏捷,大战宇宙忍者,宇宙忍者虽然施展隐身术及分身术,均被超人力霸王的透视眼识破而失效,双方展开激烈战斗,宇宙忍者忽大忽小,超人力霸王陷入苦战。
超人力霸王一时不察,遭宇宙忍者的冻结光线击中,竟然无法动弹,宇宙忍者于是残忍地将超人利霸王的双脚一节一节地用钳子手夹断,然后再把超人力霸王的双手同样一段一段地折掉,又以钳子手戳破超人力霸王健美的胸膛与腹部,拉出超人力霸王的内脏,超人力霸王浑身鲜血直流,疼痛至极,却无力反击,只能苦苦硬撑。
可怜的早田进与超人力霸王的心灵及身躯相连,自然也承受着巨大的折磨而苦不堪言,惨叫到喉咙都哑掉了。
宇宙忍者玩腻了,便用钳子手掐住超人力霸王的脖子,打算捏断超人力霸王的头部,雪上加霜的是,超人力霸王变身的十分鐘时限即将到来,濒死的超人力霸王要如何挽救颓势,击败宇宙忍者,保卫地球呢?